Son inciertos los orígenes de Margudgued. La primera referencia al pueblo data del año 1237 en el que sus tierras pertenecían a un tal R. de Urgel de Malburget (Ledesma, La encomienda de Zaragoza, p.303, nº 130).Pocas son igualmente las referencias a su historia, siendo las más significativas las que a continuación se detallan:
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- 1237. Primera referencia con el nombre «Malburget».
- 1495. «Malgudgued» cuenta con 4 fuegos o familias y es sobrecullida de Ainsa.
- 1543. Se mantiene en 4 fuegos.
- 1571. Hasta este año, el pueblo pertenecía al arcedianato de Sobrarbe, dentro del obispado de Huesca. A partir de ese momento pasa a depender del de Barbastro.
- 1609. Vuelve a aparecer con un nuevo nombre, esta vez «Malgurgued» con una población de 2 fuegos.
- 1646. Denominado «Malburgued» pertenece a la vereda de Jaca y vuelve a contar con 4 fuegos.
- 1785. Se convierte en aldea, al no sobrepasar los 50 habitantes.
- 1857. Encontramos una de sus denominaciones actuales: «Margurgued», contando con 46 habitantes y siendo una aldea del término de Boltaña. Posteriormente pasará a depender del Ayuntamiento de Sieste.
- 1970. Su población es de 51 habitantes.
- 2005. En la actualidad cuenta con las denominaciones Margudgued y Margurgued y pertenece a Boltaña.